大上研M2の古井海里さんが学振DC1に採用内定となりました
大上研M2古井海里さんが、日本学術振興会特別研究員-DC1に採用内定となりました。おめでとうございます！ 研究課題名：深層学習と自由エネルギー摂動法計算を組合せた創薬リード最適化手法の開発 採用期間：2024年4月1日～2027年3月31日 特別研究員 | 独立行政法人 日本学術振興会 人材育成事業部 研究者養成課 https://www.jsps.go.jp/j-pd/
論文が出版されました
論文「Generating Potential Protein-Protein Interaction Inhibitor Molecules Based on Physicochemical Properties」がMolecules誌より出版されました。 この論文は、化合物を仮想的に生成するREINVENTを用いて、我々が2021年に発表したQEPPIと組合せることでPPI阻害剤として望ましい性質を持っていることが期待できる化合物を […]
Cresset社のMark Mackey CSOらが大上研究室を訪問しました
Cresset Biomolecular Discovery Limited (Cresset社) のMark Mackey CSO、Krishnakumar Muraleedharan Account Manager、Ryuichiro Hara Senior Application Scientistが、大上研究室を訪れました。 Cresset社は、創薬を支援する分子設計・計算化学ソフトウェアを開発する企業で、ドッキン […]
特別セミナー開催のお知らせ
大上研究室では以下の特別セミナーを実施します。本学関係者向けですが、参加希望者がいましたら大上までご連絡ください。 日時：2023年7月7日（金） 10:00～11:00 場所：東京工業大学 すずかけ台キャンパス S8棟1階 レクチャーホール （画像クリックで拡大）
技術支援員を公募しています
東京工業大学 大上研究室では、技術支援員を１名公募しています。 詳細は以下をご覧ください。 技術支援員 １名 大上研究室における受託研究事業（JST創発的研究支援事業）の研究業務の補助 ・計算機サーバーの保守、管理（ネットワーク管理、ソフトウェア管理等を含む） ・研究データの解析と取りまとめ、MS Officeによる資料作成 ・Python (sklearn, rdkit, pytorchなど) を用いたプログラミング実装補助 ・MOE […]
論文がBiomedicines誌のEditor’s Choice Articlesに選定されました
D3小杉さんと大上の共著論文である「Solubility-Aware Protein Binding Peptide Design Using AlphaFold」(Biomedicines 2022) がBiomedicines誌のEditor’s Choice Articles (July–December 2022) に選定されました。 Kosugi T, Ohue M. Solubility-aware prote […]
東京医科歯科大学Wednesday4meetUpに大上が参加し、東京医科歯科大学ウェブサイトで紹介されました
2023年4月26日（水）、東京医科歯科大学M&Dタワーファカルティラウンジにて行われた2023年度第1回研究者・学生の交流の会（meetUP）が開催され、大上が参加した記事が東京医科歯科大学ウェブサイトで紹介されました。 「研究者・学生の交流の会（meetUP）」は学生や若手・ベテラン研究者が隔てなく異分野の研究者と情報交換し、親睦を深めることを目的として、2022年3月に東京医科歯科大学統合研究機構内に設置された若手研究者支 […]
新メンバーが加わりました（2023年4月）
大上研に 修士課程学生 ３名 学部学生 ２名 が新たに加わりました。修士進学者と合わせて、学生13名、スタッフ3名の体制になります ＞メンバーリスト
大上研M1のApakorn Kengkannaさんが情報処理学会バイオ情報学研究会優秀プレゼンテーション賞を受賞しました
大上研M1のApakorn Kengkannaさんが、情報処理学会バイオ情報学研究会(SIGBIO)優秀プレゼンテーション賞を受賞しました。 この賞は、情報処理学会バイオ情報学研究会で優秀な研究発表をした発表者に授与されるもので、第73回バイオ情報学研究会での以下の口頭発表に対して与えられました。 Apakorn Kengkanna, Masahito Ohue: “Enhancing Ligand Property and […]
大上がNVIDIA GTC2023で講演を行います
大上がNVIDIA GTC2023で講演を行います。 NVIDIA GTCはGPU Computingに関する会議で、GPUに係わる様々な講演が展開されます。 大上は「AIが加速する創薬・生命科学」と題して、GPUコンピューティングによる創薬やバイオインフォマティクスに関する研究を紹介します。 GTC2023は日本時間の2023年3月21日～24日にかけて行われ、全てがオンラインで開催されます。 参加費は無料で、オンデマン […]